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2015
S. Sebastian Raesch, Tenzer, S., Storck, W., Rurainski, A., Selzer, D., Ruge, C. Arnold, Perez-Gil, J., Schaefer, U. Friedrich, und Lehr, C. - M., „Proteomic and Lipidomic Analysis of Nanoparticle Corona upon Contact with Lung Surfactant Reveals Differences in Protein, but Not Lipid Composition“, ACS Nano, Bd. 9, Nr. 12, S. 11872 - 11885, 2015.
2013
D. Stöckel, Müller, O., Kehl, T., Gerasch, A., Backes, C., Rurainski, A., Keller, A., Kaufmann, M., und Lenhof, H. - P., „NetworkTrail--a web service for identifying and visualizing deregulated subnetworks.“, Bioinformatics, Bd. 29, Nr. 13, S. 1702-3, 2013.
2012
C. Backes, Rurainski, A., Klau, G. W., Müller, O., Stöckel, D., Gerasch, A., Küntzer, J., Maisel, D., Ludwig, N., Hein, M., Keller, A., Burtscher, H., Kaufmann, M., Meese, E., und Lenhof, H. - P., „An integer linear programming approach for finding deregulated subgraphs in regulatory networks.“, Nucleic Acids Research, Bd. 40, Nr. 6, S. e43, 2012.
2011
A. Katharina Dehof, Rurainski, A., Bui, Q. Bao Anh, Böcker, S., Lenhof, H. - P., und Hildebrandt, A., „Automated bond order assignment as an optimization problem.“, Bioinformatics, Bd. 27, Nr. 5, S. 619-25, 2011.
2010
A. Hildebrandt, Dehof, A. Katharina, Rurainski, A., Bertsch, A., Schumann, M., Toussaint, N. C., Moll, A., Stöckel, D., Nickels, S., Mueller, S. C., Lenhof, H. - P., und Kohlbacher, O., „BALL-biochemical algorithms library 1.3.“, BMC Bioinformatics, Bd. 11, S. 531, 2010.
J. Fuhrmann, Rurainski, A., Lenhof, H. - P., und Neumann, D., „A new Lamarckian genetic algorithm for flexible ligand-receptor docking.“, Journal of Computational Chemistry, Bd. 31, Nr. 9, S. 1911-8, 2010.
2009
A. Rurainski, Hildebrandt, A., und Lenhof, H. - P., „A consensus line search algorithm for molecular potential energy functions.“, Journal of Computational Chemistry, Bd. 30, Nr. 9, S. 1499-509, 2009.
J. Fuhrmann, Rurainski, A., Lenhof, H. - P., und Neumann, D., „A new method for the gradient-based optimization of molecular complexes.“, Journal of Computational Chemistry, Bd. 30, Nr. 9, S. 1371-8, 2009.